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GPU高性能計算集群

功能

計算能力的增強使得蛋白質(zhì)質(zhì)譜檢索所需的時間和分析蛋白組數(shù)據(jù)所需的時間大幅減少,而基于GPU并行計算架構的基因序列分析算法相對于傳統(tǒng)的CPU串行算法,能夠獲得幾倍、十幾倍的加速,極大地提高了科學研究工作的效率和時效性。此外,作為院內(nèi)公共計算平臺,該集群還為其他科研工作如中子學計算、顆粒流模擬、材料計算提供了支持,為近物所自主研發(fā)的高性能計算軟件提供了運行、測試平臺。

應用

該設備是基于NVIDIA KEPLER架構的GPU-CPU異構高性能計算集群。集群總共配置16個計算節(jié)點,1個管理節(jié)點,3個服務器機柜,1個64TB的磁盤存儲陣列以及1個40Gb帶寬的IB交換機。計算節(jié)點配置2個INTEL XEON E5-2630V2至強系列服務器CPU,64GB DDR3內(nèi)存,2TB硬盤,4塊NVIDIA TESLA K20高性能計算卡,1塊40Gb IB網(wǎng)卡以及1600瓦電源。集群總共擁有68塊高性能計算卡,單精度浮點計算理論峰值為239.36TFlops(239.36萬億次/秒)。

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